次氯酸鈉是一種高效氧化劑，在水中以易分解出氧氣。新生態的氧具很強的氧化能力，投入水中瞬時水解形成次氯酸和次氯酸根，次氯酸的極強氧化性破壞了菌體和病毒上的蛋白質等酶系統，對病原微生物有著很好的抑制作用。由此可見次氯酸鈉不僅可以用來消毒滅菌，還可以用來漂白有機色團，因此次氯酸南在各行各業中有著廣泛的應用，主要有以下幾種使用方式：
　　浸泡法。將待消毒的物品放入裝有含氯消毒劑溶液的容器中，然后加蓋密封。對細菌繁殖體污染的物品的消毒，用含有效氯500mg/L 的消毒液浸泡10分鐘以上。
　　擦拭法。對大件物品或其它不能用浸泡法消毒的物品用擦拭法消毒。
　　噴灑法。對一般污染的物品表面，用1000mg/L的消毒液均勻噴灑，作用30分鐘以上；對經血傳播病原體、結核桿菌等污染表面的消毒，用含有效氯2000mg/L的消毒液均勻噴灑，作用60分鐘以上。
　　干粉消毒法。對排泄物的消毒，用含氯消毒劑干粉加入排泄物中，使含有效氯10000mg/L，略加攪拌后，作用2至6小時，對醫院污水的消毒，用干粉按有效氯50mg/L用量加入污水中，并攪拌均勻，作用2小時后排放。